NPDC-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-421942

概要

Npdc1 は、神経系における細胞周期の進行や成熟プログラムの制御に関与するとされる、神経・グリア分化関連タンパク質 NPDC-1 をコードします。NPDC-1 は、増殖状態から分化状態への移行の調節に関わることが示唆されており、神経系の系譜において転写出力や増殖制御経路に影響を与える相互作用が報告されています。マウスモデルや神経細胞系では、NPDC-1 活性の変化を利用して、神経突起の伸長、神経可塑性、系譜決定の機構を検討します。これらの過程の破綻は、神経発生異常や、神経組織における異常増殖に関連した細胞状態と関係します。

NPDC-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるNpdc1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Npdc1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Npdc1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、NPDC-1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、NPDC-1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Npdc1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• NPDC-1の機能に不可欠なNpdc1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Npdc1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• NPDC-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびNPDC-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Npdc1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  NPDC-1 HDRプラスミド（m）および NPDC-1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはNpdc1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のNpdc1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。