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MBD2 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401561-ACT | 20 µg | $397.00 |
ヒトMBD2(methyl-CpG binding domain protein 2)はDNAメチル化を読み取る因子(リーダー)であり、メチル化されたCpGジヌクレオチドに結合して、エピジェネティックな標識を転写の帰結へとつなげる役割を担います。MBD2は、NuRDなどのクロマチンリモデリング複合体やヒストン脱アセチル化酵素(HDAC)複合体との相互作用を介して、遺伝子サイレンシング、クロマチンの凝縮、系統特異的プログラムの制御に寄与します。細胞分化、免疫シグナル伝達、ゲノム全体のエピジェネティック安定性の維持などの過程にも影響を及ぼします。MBD2活性の制御異常やメチル化依存的抑制の変化は、がんをはじめとするエピジェネティック不均衡を伴う疾患で認められる異常な転写ネットワークと関連づけられています。
MBD2 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性MBD2の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
MBD2 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における MBD2 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はMBD2転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性MBD2の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のMBD2遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるMBD2依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびMBD2発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるMBD2経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。