LI-cadherin CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-401229

概要

CDH17は、腸管上皮に豊富に発現する非典型的カドヘリンであるLI-カドヘリンをコードしており、カルシウム依存的な細胞間接着を仲介するとともに、上皮の極性やバリア機能に寄与します。古典的カドヘリンとは異なり、LI-カドヘリンは典型的なカテニン結合ドメインを欠いており、そのことが、接着結合の構築、組織構築、細胞選別を制御する独自の機構と関連しています。CDH17の発現量や局在の変化は、消化管上皮のリモデリングや、腫瘍に伴う接着・浸潤・分化プログラムの変化の研究で頻繁に検討されています。系統（ラインエージ）関連の接着分子として、LI-カドヘリンは、膜接着受容体が細胞骨格制御、接触阻害、微小環境からのシグナルとどのように連携するかを解析する際にも用いられます。

LI-cadherin CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるCDH17遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、CDH17内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、CDH17のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、LI-cadherinタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、LI-cadherinシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、CDH17欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• LI-cadherinの機能に不可欠なCDH17エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、CDH17ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• LI-cadherin CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびLI-cadherin CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、CDH17遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  LI-cadherin HDRプラスミド（h）および LI-cadherin HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはCDH17ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のCDH17標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。