KCTD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-406758

概要

KCTD1（potassium channel tetramerization domain containing 1）は、BTB/POZドメインを有するタンパク質をコードしており、転写制御や細胞分化プログラムに影響を与えるタンパク質間相互作用ネットワークに関与するとされています。KCTDファミリーのメンバーは一般に、Cullin3（CUL3）を基盤とするE3ユビキチンリガーゼ複合体におけるアダプタータンパク質として機能し、特定の基質をユビキチン依存的分解へと結び付けることで、シグナル伝達の出力を調整します。こうした制御機能を通じて、KCTD1は発生過程や細胞アイデンティティの維持と関連付けられており、遺伝学的な機能破綻は外胚葉系組織に影響する先天性疾患との関連が報告されています。生物医学研究では、KCTD1は疾患表現型に関わるシグナル経路の調節、プロテオスタシス、ならびに遺伝子制御回路の観点から研究されています。

KCTD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるKCTD1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、KCTD1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、KCTD1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、KCTD1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、KCTD1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、KCTD1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• KCTD1の機能に不可欠なKCTD1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、KCTD1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• KCTD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびKCTD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、KCTD1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  KCTD1 HDRプラスミド（h）および KCTD1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはKCTD1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のKCTD1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。