HoxA3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-404634

概要

HOXA3はホメオボックス型転写因子HoxA3をコードしており、配列特異的にDNAへ結合して遺伝子発現を制御することで、胚発生における前後軸（頭尾軸）のアイデンティティをパターニングし、形態形成、上皮分化、組織リモデリングを司るプログラムを統合的に調整します。HoxA3はHOXクラスターの制御ネットワークに組み込まれて機能し、WNT、BMP/TGF-β、レチノイン酸などの発生シグナル伝達経路とも交差しながら、細胞運命決定や空間的な遺伝子発現パターンの形成に関与します。成人組織においては、HOXA3の発現変化やエピジェネティックな制御異常が、がんをはじめとする発生関連遺伝子の再活性化を伴う疾患で見られる異常な分化状態や転写プログラムの再配線と関連づけられています。核内の制御因子として、HoxA3は遺伝子制御ネットワークのマッピング、系譜決定モデル、クロマチンを介した転写制御の研究で頻繁に解析対象となっています。

HoxA3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHOXA3遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HOXA3内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HOXA3のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、HoxA3タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、HoxA3シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HOXA3欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• HoxA3の機能に不可欠なHOXA3エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HOXA3ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• HoxA3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびHoxA3 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HOXA3遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  HoxA3 HDRプラスミド（h）および HoxA3 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHOXA3ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHOXA3標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。