hnRNP R CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-404489

概要

HNRNPRは、ヒトのヘテロ核リボヌクレオタンパク質R（hnRNP R）をコードしています。hnRNP RはRNA結合タンパク質で、新生転写産物やリボヌクレオタンパク質複合体と会合し、pre-mRNAのプロセシング、mRNAの安定性、ならびに細胞内でのRNA局在を調節します。hnRNP Rは、選択的スプライシングやRNA輸送に影響を与える相互作用を介して転写後の遺伝子発現制御に寄与し、核内のRNA代謝と細胞質での翻訳制御を結び付けます。RNA結合タンパク質やスプライシング関連ネットワークの制御異常は、神経変性疾患や神経筋疾患の機序に関与すると考えられており、HNRNPRはRNA恒常性を研究する上で有用なノードとなります。hnRNP Rを実験的に解析することにより、トランスクリプトーム再編の経路レベル解析、ストレス応答性RNA顆粒の動態、そしてプロテオスタシスに関連する表現型の評価が可能になります。

hnRNP R CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるHNRNPR遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、HNRNPR内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、HNRNPRのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、hnRNP Rタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、hnRNP Rシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、HNRNPR欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• hnRNP Rの機能に不可欠なHNRNPRエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、HNRNPRゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• hnRNP R CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびhnRNP R CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、HNRNPR遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  hnRNP R HDRプラスミド（h）および hnRNP R HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはHNRNPRホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のHNRNPR標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。