GATA-6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-400724

概要

GATA6はGATA-6をコードしており、GATA-6はGATAモチーフに結合する亜鉛フィンガー型転写因子として、内胚葉および中胚葉由来組織における系譜決定や分化プログラムの制御に関与します。NKX2-5やTBXファミリー因子などと転写ネットワークを形成して器官形成や細胞運命の決定を協調的に調節し、さらにWNT、BMP、TGF-β経路を含むシグナル入力とも連携します。成体細胞では、GATA-6は上皮および平滑筋の遺伝子制御、細胞代謝、ストレス応答性の転写リモデリングに寄与します。GATA6活性の破綻は発生異常と関連しており、がんを含む複数の疾患モデルにおいて観察される分化状態の変化や転写依存性の観点からもしばしば研究されています。

GATA-6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるGATA6遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、GATA6内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、GATA6のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、GATA-6タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、GATA-6シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、GATA6欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• GATA-6の機能に不可欠なGATA6エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、GATA6ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• GATA-6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびGATA-6 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、GATA6遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  GATA-6 HDRプラスミド（h）および GATA-6 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはGATA6ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のGATA6標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。