EPC2 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-407068

Panoramica

EPC2 (enhancer of polycomb homolog 2) codifica una proteina associata alla cromatina che funziona come componente delle reti regolatorie del gruppo Polycomb, contribuendo al controllo epigenetico della trascrizione. EPC2 partecipa a complessi multiproteici che influenzano gli stati di modificazione degli istoni e l’accessibilità della cromatina, plasmando così programmi che governano l’identità cellulare, la proliferazione e la differenziazione. Attraverso questi meccanismi, EPC2 collega il rimodellamento della cromatina alle dinamiche di repressione/attivazione trascrizionale in loci regolati durante lo sviluppo. Alterazioni della regolazione epigenetica dipendente da EPC2 sono state studiate nel contesto di firme di espressione genica deregolate osservate nel cancro e in altri disturbi caratterizzati da un controllo anomalo della cromatina.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO EPC2 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene EPC2 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del EPC2 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto EPC2 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina EPC2.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di EPC2 per lo studio della segnalazione di EPC2, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni EPC2 critici per la funzione di EPC2
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di EPC2 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal EPC2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal EPC2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus EPC2. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal EPC2 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR EPC2 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia EPC2 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio EPC2 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.