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cadherin-20 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401925-ACT | 20 µg | $397.00 |
PCDHGB4 は、カルシウム依存的な細胞間接着および細胞表面の認識複合体の編成に関与するとされるプロトカドヘリンファミリーの一員であるカドヘリン-20をコードします。プロトカドヘリンは、接着結合の安定性や接触依存的シグナル伝達を調節することで、組織のパターニングや細胞構築の維持に寄与し、その下流で細胞骨格ダイナミクスや遺伝子発現プログラムにも影響を及ぼします。カドヘリン/プロトカドヘリンの発現異常は、接着・遊走・分化状態の制御不全と関連づけられており、発生障害や腫瘍形成過程に関与する現象として重要です。より広いカドヘリンネットワークの一部として、カドヘリン-20はしばしば、接着を介したシグナル伝達や系統特異的な転写制御の文脈で研究されています。
cadherin-20 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性PCDHGB4の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
cadherin-20 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における PCDHGB4 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はPCDHGB4転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性cadherin-20の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のPCDHGB4遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるcadherin-20依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびPCDHGB4発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるcadherin-20経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。