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BRD3 CRISPR Activationプラスミド (h) | sc-401493-ACT | 20 µg | $397.00 |
BRD3(bromodomain containing 3)は、ヒストン上のアセチル化リジンにタンデム型ブロモドメインを介して結合し、クロマチン状態を転写出力へと結び付けるエピジェネティックなリーダータンパク質であるBETファミリーの一員です。BRD3は、RNAポリメラーゼII依存性転写の制御、エンハンサーおよびスーパーエンハンサー機能、ならびに細胞周期進行や分化プログラムに関わるクロマチン関連制御に関与します。アセチル化クロマチンや転写共調節因子との相互作用を通じて、BRD3は炎症シグナル伝達や系譜特異的転写に結び付いた遺伝子発現ネットワークの形成に寄与します。BRD3に関連する転写プログラムの変化を含むBETタンパク質活性の破綻は、腫瘍性の転写依存性や、クロマチン駆動の異常な遺伝子制御を特徴とするその他の疾患に関与することが示唆されています。
BRD3 CRISPR活性化プラスミド(h)は、基盤となるDNA配列を変更することなく、内因性BRD3の発現を標的化し、非破壊的にアップレギュレートするアプローチを提供します。
BRD3 CRISPR 活性化プラスミド (h) は、ヒト細胞株における BRD3 遺伝子座の高効率かつ部位特異的な転写アップレギュレーションのために設計された、3 つのプラスミドからなる相乗的活性化メディエーター (SAM) システムです。このシステムは、DNA結合能を維持しつつヌクレアーゼ活性を失わせる2つの不活性化変異(D10AおよびN863A)を有する、触媒活性のないCas9(dCas9)を中核としています。このdCas9は、強力な転写活性化因子であるVP64と融合しており、選別用のブラスティシジン耐性遺伝子と共に共発現します。2番目のプラスミドは、dCas9-VP64と協調して機能する二次活性化複合体であるMS2-p65-HSF1融合タンパク質をコードしており、ヒグロマイシン耐性遺伝子と共に発現する。3番目のプラスミドは、標的特異的な20塩基対のsgRNAをコードしており、これはMS2-p65-HSF1複合体を活性化部位に誘導する2つのMS2 RNAアプタマーと融合しており、さらにピューロマイシン耐性遺伝子が付随している。これら3つのプラスミドは、システム構成要素すべてが均等に発現するよう、質量比1:1:1で導入される。
標的遺伝子座に集合すると、SAM複合体はBRD3転写開始点の上流約200 bpの領域に結合し、そこでVP64、p65、およびHSF1が協調して転写装置を動員し、内因性BRD3の発現上昇を促進する。ヌクレアーゼ活性を持つCas9とは異なり、 dCas9は二本鎖切断を導入したりゲノム配列を改変したりしないため、天然のBRD3遺伝子座が保持され、内因性遺伝子座におけるBRD3依存性の転写応答の研究が可能となります。これにより、機能解析、標的遺伝子の同定、およびBRD3発現が沈黙または低下した腫瘍細胞におけるBRD3経路の回復のモデル化を行う上で、貴重なツールとなります。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。