Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
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BAT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-403785
- 対象生物種: human
- 20 µg のトランスフェクション準備済み、精製したプラスミドDNA、～20回トランスフェクション
- BAT1 CRISPR/Cas9 ノックアウト（KO）プラスミド（h）は、GeCKO v2ライブラリ由来の配列を用いて最大のノックアウト効率を実現するよう設計された、Cas9ヌクレアーゼおよび標的特異的な20塩基対のガイドRNA（gRNA）をそれぞれコードするプラスミドのプールです
- gRNA配列は、Cas9を誘導してBAT1ゲノム座において部位特異的な二本鎖切断（DSBs）を引き起こし、非相同末端結合（NHEJ）を介して遺伝子ノックアウトをもたらします
- ピューロマイシン耐性遺伝子とRFP遺伝子はLoxP部位で挟まれているため、安定したノックアウト細胞株を樹立した後、Creリコンビナーゼ（Creベクター：sc-418923）を用いて選択マーカーを除去することができる。
注文情報
| 製品名 | カタログ # | 単位 | 価格 | 数量 | お気に入り | |
BAT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h) | sc-403785 | 20 µg | $397.00 |
概要
DDX39BはBAT1（UAP56とも呼ばれる）をコードしており、前駆体mRNAスプライシングおよびmRNA輸送の過程で、ATP依存的にRNA–タンパク質複合体を再編成する、保存性の高いDEADボックス型RNAヘリカーゼです。BAT1はTREX／輸送（export）機構と協調して、転写、スプライソーム動態、核外輸送を連結し、その結果として遺伝子発現プログラムとRNA品質管理を形成します。これらの役割を通じて、DDX39Bの活性は、RNAプロセシングに関連する細胞増殖、ストレス応答、ならびに自然免疫シグナル伝達に影響を及ぼします。RNAヘリカーゼやmRNP生合成の制御異常は、しばしば腫瘍性の転写状態や炎症性表現型と関連するため、BAT1は疾患関連モデルにおけるRNA代謝の機構解析に有用な標的となります。
BAT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるDDX39B遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、DDX39B内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。
このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、DDX39Bのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、BAT1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。
このCRISPRノックアウトシステムにより、BAT1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、DDX39B欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。
主な特徴
- BAT1の機能に不可欠なDDX39Bエクソンを標的とするsgRNA
導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
ノックアウト効率を向上させるための、DDX39Bゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
トランスフェクションによる導入に対応
設計バリエーション
CRISPRs +/- HDR
- BAT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびBAT1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、DDX39B遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
BAT1 HDRプラスミド（h）および BAT1 HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはDDX39Bホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のDDX39B標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。
研究用のみ。診断用または治療用ではありません。