ARID3A CRISPR/Cas9 KOプラスミド (h): sc-404552

概要

ARID3A（AT-rich interaction domain 3A）はDNA結合性の転写因子であり、クロマチンのアクセシビリティと系譜特異的な遺伝子発現プログラムを制御します。造血系ではB細胞の発生および免疫グロブリン遺伝子の制御と強く関連しており、分化・増殖・アポトーシスを協調して制御する転写ネットワークに組み込まれています。ARID3Aの活性は標的遺伝子座のエピジェネティックな制御に影響し、発生シグナルやストレス刺激に対する細胞応答にも作用し得ます。ARID3Aの発現や機能の異常は免疫細胞の表現型変化と関連しており、血液悪性腫瘍や自己免疫などの文脈で研究されています。

ARID3A CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）は、human細胞株におけるARID3A遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、ARID3A内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、ARID3Aのオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、ARID3Aタンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、ARID3Aシグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、ARID3A欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• ARID3Aの機能に不可欠なARID3Aエクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、ARID3Aゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• ARID3A CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h）およびARID3A CRISPR/Cas9 KOプラスミド（h2）によってコードされるgRNAは、ARID3A遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  ARID3A HDRプラスミド（h）および ARID3A HDRプラスミド（h2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはARID3Aホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のARID3A標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。