Os inibidores químicos da ZNF554 podem atuar através de várias vias para inibir a função da proteína. O PD98059 e o U0126 são inibidores da MEK que interrompem a cascata de sinalização MAPK/ERK, uma via que é frequentemente crucial para a função de proteínas de dedo de zinco como a ZNF554. Quando a MEK é inibida, a fosforilação subsequente da ERK é reduzida, levando a uma diminuição das acções reguladoras que a ERK pode exercer sobre o ZNF554. Do mesmo modo, o SP600125 tem como alvo a JNK, outra quinase da via MAPK, que também pode influenciar os mecanismos reguladores que controlam a atividade do ZNF554. O SB203580 inibe especificamente a p38 MAPK, que, se envolvida na fosforilação e regulação do ZNF554, resultaria numa diminuição da atividade da proteína devido à falta de sinais de fosforilação da p38.
O LY294002 e a Wortmannin são ambos inibidores da PI3K, o que resulta numa atividade reduzida da via AKT. Uma vez que a via de sinalização PI3K/AKT está frequentemente implicada na regulação de várias proteínas, incluindo as proteínas de dedo de zinco, a inibição desta via pode levar a uma diminuição da atividade do ZNF554. A rapamicina, um inibidor da mTOR, pode interromper a sinalização a jusante que pode ser essencial para a função da ZNF554, inibindo assim a atividade da proteína. O Gefitinib e o Erlotinib têm como alvo o EGFR, um recetor tirosina quinase que inicia uma série de cascatas de sinalização intracelular, incluindo as que podem regular o ZNF554. A inibição do EGFR pode impedir a ativação destas vias a jusante, reduzindo assim a atividade do ZNF554. O sorafenib, um inibidor do RAF, actua sobre as cinases a montante da via MAPK, o que, por extensão, diminuiria a influência reguladora sobre o ZNF554. O Dasatinib, um inibidor da quinase da família Src, e o Imatinib, conhecido pela sua inibição da tirosina quinase BCR-ABL, podem também levar a uma redução da atividade das cinases que estão possivelmente ligadas às vias de sinalização que regulam o ZNF554, inibindo assim a função da proteína.
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