Os inibidores químicos da ZNF550 podem exercer os seus efeitos através de várias vias de sinalização intracelular que são críticas para a regulação funcional desta proteína. Sabe-se que os inibidores de MEK PD98059 e U0126 inibem a via MAPK/ERK, uma via fundamental para a transmissão de sinais dos receptores de superfície para o ADN no núcleo da célula. A inibição desta via pode resultar na diminuição da atividade do ZNF550 se a função da proteína depender dos eventos de fosforilação que são regidos pela MEK. Numa nota semelhante, o SP600125, como inibidor da JNK, e o SB203580, que tem como alvo a p38 MAP quinase, estão ambos envolvidos na obstrução dos mecanismos de sinalização que poderiam governar os processos reguladores do ZNF550, levando a um estado funcional diminuído da proteína. Estes inibidores poderiam impedir a fosforilação ou a ativação de proteínas intermediárias que modulam a atividade do ZNF550.
Ainda no domínio da inibição da quinase, o LY294002 e a Wortmannin são inibidores da PI3K e a sua ação perturba a via PI3K/Akt. Esta perturbação pode levar a uma diminuição da atividade do ZNF550 se a sinalização PI3K for necessária para a sua plena atividade. O inibidor de mTOR Rapamicina também desempenha um papel fundamental, uma vez que pode inibir a via de sinalização mTOR, que pode ser essencial para o bom funcionamento do ZNF550. Os inibidores do EGFR, Gefitinib e Erlotinib, podem inibir as vias de sinalização a jusante, como a MAPK/ERK e a PI3K/Akt, que podem ser cruciais para a expressão funcional do ZNF550. De forma semelhante, o sorafenib, enquanto inibidor da RAF, pode bloquear elementos a montante destas cascatas de sinalização, inibindo assim indiretamente o ZNF550. O Dasatinib e o Imatinib, ao terem como alvo as cinases da família Src e a tirosina cinase BCR-ABL, respetivamente, podem reduzir a atividade do ZNF550 se a função da proteína estiver ligada a sinais propagados através destas cinases.
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