Os activadores do ZNF409 incluem um conjunto diversificado de compostos químicos que funcionam através de várias vias celulares para aumentar a atividade da proteína. Um tema comum entre vários destes activadores é a sua capacidade de alterar os níveis intracelulares de segundos mensageiros, como o AMPc e o cálcio. Estes segundos mensageiros desempenham papéis fundamentais na regulação da atividade dos factores de transcrição e podem aumentar a capacidade de ligação ao ADN da ZNF409, permitindo-lhe modular mais eficazmente a expressão genética. Além disso, certos activadores podem influenciar a arquitetura da cromatina, inibindo as enzimas responsáveis pela metilação do ADN e pela desacetilação das histonas. Estas alterações na regulação epigenética podem tornar o ADN mais acessível ao ZNF409, aumentando assim os seus efeitos reguladores da transcrição. Além disso, alguns activadores actuam através da inibição de cinases-chave nas vias de sinalização, levando à modulação de factores de transcrição e co-reguladores que podem interagir com o ZNF409, reforçando assim o seu papel como regulador da transcrição.
Os mecanismos moleculares pelos quais estes activadores operam estendem-se ainda à modulação das vias de transdução de sinal que interagem com a maquinaria transcricional. Por exemplo, a ativação da proteína quinase C tem sido associada a eventos de fosforilação que podem potenciar a ligação ao ADN e a atividade transcricional de proteínas de dedo de zinco como a ZNF409. Noutra frente, activadores específicos que actuam através da cascata de sinalização β-adrenérgica resultam de forma semelhante em níveis elevados de AMPc, o que pode facilitar a participação do ZNF409 na transcrição. Além disso, a manipulação da sinalização dos receptores nucleares por certos metabolitos bioactivos conduz a alterações transcricionais que podem promover o papel do ZNF409 na regulação dos genes.
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