Os inibidores da TR2IT1 englobam uma gama de compostos químicos que suprimem a atividade funcional da TR2IT1 através de vários mecanismos celulares e moleculares. O estradiol e o tamoxifeno, ao modularem a via do recetor de estrogénio, alteram o recrutamento de coactivadores da transcrição de que o TR2IT1 necessita, diminuindo assim a sua atividade. Os inibidores da histona desacetilase, como a Tricostatina A e o Ácido Suberoilanilida Hidroxâmico, remodelam a arquitetura da cromatina, o que pode inibir a interação do TR2IT1 com os complexos transcricionais, levando a uma redução do seu papel funcional na expressão genética. Além disso, o fluorouracilo perturba a função da polimerase do ARN e a actinomicina D intercala-se no ADN, dificultando o processo de transcrição em que o TR2IT1 está envolvido. A alfa-amanitina tem como alvo a RNA polimerase II para diminuir a síntese de mRNA para genes regulados por TR2IT1. Coletivamente, estes inibidores exercem os seus efeitos interferindo diretamente com a maquinaria de transcrição ou alterando as modificações pós-traducionais das proteínas que interagem com o TR2IT1.
Além disso, a atividade da proteína TR2IT1 pode ser indiretamente afetada por compostos que visam as principais vias de sinalização. A rapamicina, através da inibição da mTOR, e o PD 98059, ao bloquear a MEK, podem reduzir a fosforilação dos factores de transcrição com os quais a TR2IT1 pode interagir, atenuando assim a sua influência transcricional. O SP600125, como inibidor da JNK, e o LY 294002, um inibidor da PI3K, modulam as vias de sinalização que podem influenciar a dinâmica dos factores de transcrição e dos coactivadores envolvidos na função do TR2IT1. O MG-132 impede a degradação proteasomal, aumentando potencialmente os níveis de proteínas que reprimem a atividade do TR2IT1, ao mesmo tempo que afecta o turnover das proteínas reguladoras da transcrição. Esta abordagem integrada de utilização de inibidores químicos para atingir vários componentes da sinalização celular e da regulação da transcrição fornece uma estratégia multifacetada para diminuir a atividade funcional do TR2IT1 sem interferir diretamente com a sua expressão. Estes inibidores actuam em diferentes aspectos do processo de regulação da transcrição a que o TR2IT1 está associado, desde a acessibilidade da cromatina e a disponibilidade de factores de transcrição até às modificações pós-traducionais e à síntese de ARNm, conseguindo assim, coletivamente, um estado funcional reduzido do TR2IT1.
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