Os activadores da sintaxina 11 funcionam em grande parte através da modulação dos sinais e processos intracelulares que influenciam a atividade da sintaxina 11. Muitos destes activadores estão envolvidos em vias que influenciam o tráfico e a fusão de vesículas, um papel fundamental da Syntaxin 11.
Por exemplo, a tapsigargina, a nifedipina e o BAPTA-AM modulam os níveis de cálcio, que se sabe influenciarem o papel da sintaxina 11 na exocitose dependente do cálcio. Outro mecanismo comum destes activadores é através da modulação da atividade da quinase. A forskolina, o PMA, a esturosporina e os inibidores da PI3K, Wortmannin e LY294002, influenciam a atividade da sintaxina 11 através dos seus efeitos nas proteínas cinases. Estas cinases podem fosforilar a sintaxina 11 ou outras proteínas envolvidas no processo de exocitose, influenciando assim a atividade da sintaxina 11. Além disso, activadores como o 1-Butanol e o Cloreto de Calmidazólio influenciam a atividade da Sintaxina 11 através da modulação da sinalização lipídica e da atividade da calmodulina, respetivamente, que são outros componentes-chave do processo de exocitose.
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