Os inibidores químicos da SAMD13 funcionam através de diversos mecanismos para diminuir a sua atividade nas vias de sinalização celular. O LY294002 e a Wortmannin actuam como inibidores da fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K), um nó de sinalização fundamental a montante de muitos processos celulares. Ao inibir a PI3K, estes produtos químicos podem reduzir a ativação de efectores a jusante que são críticos para a atividade funcional da SAMD13. A rapamicina tem como alvo a via mTOR, que é um regulador central do crescimento e da proliferação celular. Através da inibição da mTOR, a rapamicina pode reduzir a regulação de vários processos celulares, levando potencialmente a uma diminuição da função da SAMD13 nessas vias.
Para além disso, o PD98059 e o U0126 exercem os seus efeitos inibitórios ao visar a MEK1/2, enzimas chave na via MAPK/ERK. A inibição da MEK impede a ativação de cinases a jusante, o que pode ser necessário para que a SAMD13 exerça a sua função. O SB203580 e o SP600125 inibem as vias p38 MAPK e JNK, respetivamente, que estão envolvidas nas respostas celulares ao stress e às citocinas. Ao inibir estas cinases, os produtos químicos podem restringir a atividade da SAMD13 em relação à sinalização relacionada com o stress. Além disso, o Y-27632 pode reduzir a dinâmica do citoesqueleto de actina através da inibição da ROCK, o que pode influenciar indiretamente a função da SAMD13 associada à organização do citoesqueleto. O Dasatinib e o PP2, ambos inibidores da Src quinase, podem suprimir cascatas de sinalização específicas que envolvem a SAMD13, limitando assim a sua atividade. Do mesmo modo, o SL327 inibe a MEK1/2, impedindo a ativação de cinases em certas vias de sinalização em que a SAMD13 pode participar. Por último, o GSK690693, um inibidor da Akt, pode regular negativamente os processos a jusante da ativação da Akt, onde a SAMD13 poderia estar a desempenhar um papel. Através da inibição da Akt, este químico pode controlar as funções celulares que são influenciadas pela atividade da SAMD13.
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