Os inibidores do RNF145 actuam através de uma variedade de mecanismos bioquímicos que convergem todos para a via comum da ubiquitinação, um processo crucial para a renovação das proteínas e a regulação celular. A inibição do proteassoma com compostos que se ligam aos seus locais activos conduz a uma acumulação de proteínas ubiquitinadas, que podem afetar indiretamente a função do RNF145 ao sobrecarregar o sistema proteolítico de que este depende. Ao inibir o proteassoma, estes compostos impedem eficazmente a degradação das proteínas que o RNF145 marcou para a sua renovação, reduzindo assim a eficácia do papel do RNF145 na homeostase proteica celular. Isto é exemplificado pelos aldeídos peptídicos e derivados do ácido borónico, que interferem com a capacidade do proteassoma para reconhecer e processar substratos ubiquitinados, levando a uma acumulação que limita indiretamente a função do RNF145.
Além disso, os inibidores que visam os processos a montante da ubiquitinação, como os que afectam a neddilação das proteínas cullina ou a enzima activadora da ubiquitina E1, podem inibir indiretamente o RNF145 ao perturbar a via ubiquitina-proteassoma. O processo de neddilação é essencial para a função das ubiquitina ligases cullin-RING, para as quais o RNF145 pode contribuir, e ao impedir este processo, a atividade global de ubiquitinação pode ser reduzida. Do mesmo modo, ao inibir as etapas iniciais da ativação da ubiquitina e da conjugação com as proteínas-alvo, estes compostos podem diminuir a atividade funcional do RNF145, impedindo a marcação das proteínas para degradação. Os inibidores da deubiquitinase equilibram ainda mais o equilíbrio da ubiquitinação, impedindo a remoção das cadeias de ubiquitina, o que poderia levar indiretamente à inibição da atividade do RNF145, estabilizando os seus substratos contra a degradação proteasómica.
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