Os inibidores químicos da PRRG3 utilizam uma variedade de mecanismos para inibir a atividade desta proteína. A estaurosporina actua como um potente inibidor da cinase, impedindo a fosforilação necessária para a ativação da PRRG3. Do mesmo modo, a Wortmannin e o LY294002 têm como alvo específico as fosfoinositídeos 3-quinases (PI3K), interrompendo as vias de sinalização dependentes de PI3K que fazem parte integrante da função da PRRG3. A rapamicina segue outra via, inibindo a via mTOR, que está envolvida na regulação da síntese proteica e dos processos celulares, suprimindo assim indiretamente a atividade do PRRG3. O palbociclib contribui para a inibição ao ter como alvo as cinases 4 e 6 dependentes da ciclina (CDK4/6), que são cruciais para a progressão do ciclo celular, um processo em que o PRRG3 pode desempenhar um papel.
A inibição adicional de PRRG3 é conseguida através da interrupção da via MAPK/ERK por PD98059 e U0126, ambos inibidores de MEK, impedindo assim qualquer ativação de PRRG3 mediada pela via MAPK/ERK. Além disso, o SP600125, um inibidor da JNK, interrompe as vias da proteína quinase activada pelo stress que poderiam envolver o PRRG3, levando à sua inibição. O SB203580 adopta uma abordagem semelhante ao inibir a p38 MAP quinase, bloqueando assim as vias da p38 MAPK que regulam a PRRG3. O Dasatinib e o Sunitinib, ambos inibidores da tirosina cinase, inibem o PRRG3 bloqueando as vias de sinalização dependentes da tirosina cinase em que este se baseia. Por último, a triciribina actua inibindo a Akt, que é conhecida por regular os sinais de sobrevivência e crescimento que são críticos para a função do PRRG3, resultando na regulação negativa da sua atividade. Cada uma destas substâncias químicas tem como alvo vias bioquímicas ou processos celulares específicos para exercer uma inibição funcional sobre o PRRG3.
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