Os inibidores do PNMA6A abrangem uma série de compostos que afectam várias vias bioquímicas, levando a uma diminuição da atividade funcional do PNMA6A. Alguns inibidores têm como alvo os canais iónicos; por exemplo, um bloqueador de canais específico que tem como alvo os receptores NMDA pode levar à redução da atividade funcional do PNMA6A devido à diminuição do influxo de cálcio. Este facto é particularmente relevante, uma vez que a sinalização do cálcio é crucial para múltiplos processos intracelulares e as alterações na homeostasia do cálcio podem ter efeitos profundos na função das proteínas. Outro inibidor actua como antagonista dos receptores de dopamina, o que pode diminuir a sinalização dopaminérgica e, por conseguinte, intercetar as vias envolvidas no PNMA6A, reduzindo a atividade do PNMA6A. Além disso, os compostos que inibem a mTOR ou a PI3K podem afetar os estados de fosforilação de proteínas que potencialmente interagem com o PNMA6A, quer a montante quer a jusante, levando a uma diminuição da sua atividade funcional.
Para exemplificar ainda mais a diversidade dos inibidores do PNMA6A, alguns compostos têm como alvo direto enzimas-chave nas vias de transdução de sinal. Os inibidores da MEK, por exemplo, interrompem a via da MAPK e podem influenciar a sinalização a jusante que afecta a função do PNMA6A, levando a uma diminuição da sua atividade. Do mesmo modo, os inibidores da quinase dependente da calmodulina e da PKC podem alterar as vias de sinalização em que o PNMA6A pode participar, reduzindo assim a sua atividade. Os inibidores dos receptores de tirosina quinase, como o EGFR, também têm o potencial de prejudicar a sinalização a jusante que envolve o PNMA6A. Outro conjunto de compostos inclui inibidores da proteína quinase II dependente de Ca2+/calmodulina, que, ao afectarem as vias de sinalização, podem resultar numa diminuição da atividade funcional do PNMA6A.
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