Os inibidores químicos da PIG11 funcionam perturbando as principais vias de sinalização que são essenciais para a sua atividade. A Wortmannin e o LY294002 são ambos inibidores da fosfoinositídeo 3-quinases (PI3K), que desempenham um papel fundamental na via de sinalização PI3K/AKT, uma via crucial para a função de muitas proteínas, incluindo a PIG11. Estes inibidores impedem a fosforilação e a subsequente ativação da AKT, uma quinase conhecida por estar a montante de numerosos processos celulares. Como resultado, a atividade da PIG11 é suprimida devido à falta dos sinais de ativação necessários. Do mesmo modo, a Triciribina e a Perifosina têm como alvo específico a AKT. A Triciribina inibe a fosforilação da AKT, enquanto a Perifosina impede a sua ativação. Consequentemente, estas acções resultam na inibição funcional do PIG11, uma vez que a cascata de sinalização em que o PIG11 se baseia é interrompida.
Além disso, a Rapamicina e o Torin 1 são inibidores do mTOR que levam à desregulação de processos potencialmente vitais para a função da PIG11. Ao ligar-se ao FKBP12 e inibir o mTOR, a rapamicina interrompe a via de sinalização do mTOR, que tem efeitos a jusante na síntese proteica e noutras funções celulares. O Torin 1, de forma semelhante, é potente na sua inibição do mTOR, interferindo assim com o ambiente celular necessário para a atividade do PIG11. O MK-2206, o GSK690693 e o AZD5363 são inibidores adicionais que têm como alvo a AKT. O MK-2206 funciona como um inibidor alostérico, o GSK690693 compete com o ATP para inibir a AKT e o AZD5363 impede a fosforilação da AKT, o que leva a uma diminuição da sinalização a jusante necessária para a atividade da PIG11. O Palomid 529, um derivado da Rapamicina, e a Miltefosina actuam ambos para suprimir a via mTOR/AKT, contribuindo para a inibição da PIG11. Por último, a Spautin-1 promove a degradação das PI3K de classe I, reduzindo ainda mais a sinalização PI3K/AKT e, por conseguinte, a atividade da PIG11. Cada um destes produtos químicos, por vários meios, interrompe efetivamente as vias de sinalização que permitem o funcionamento da PIG11 na célula.
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