Sabe-se que a forskolina aumenta os níveis de AMP cíclico (cAMP) nas células, o que, por sua vez, ativa a proteína quinase A (PKA). A PKA tem influência na fosforilação de várias proteínas, incluindo potencialmente o PAQR4, o que poderia alterar a sua função. Um outro produto químico, o IBMX, actua para impedir a degradação do AMPc, promovendo assim indiretamente a ação da PKA, que pode também ter um efeito a jusante no PAQR4. O 12-miristato 13-acetato de forbol, vulgarmente designado por PMA, é um ativador da proteína quinase C (PKC). A PKC faz parte de uma via de sinalização que pode conduzir a numerosas respostas celulares. A sua ativação pode desencadear uma cascata que pode, em última análise, influenciar a atividade do PAQR4, embora a ligação exacta entre a ativação da PKC e o PAQR4 não esteja totalmente estabelecida.
O galato de epigalocatequina (EGCG) é conhecido pelas suas propriedades antioxidantes. Afecta várias vias de sinalização no interior da célula, algumas das quais poderiam cruzar-se com as reguladas pelo PAQR4. No entanto, os efeitos específicos da EGCG sobre o PAQR4 não estão bem definidos e requerem mais investigação para serem clarificados. Vários inibidores de cinase, como o LY294002 e a Wortmannin, têm como alvo a PI3K, alterando potencialmente a via de sinalização da AKT. Uma vez que a AKT é uma quinase central em muitos processos celulares, a sua inibição poderia ter impacto na atividade do PAQR4. Do mesmo modo, o PD98059 e o U0126 são inibidores da via MAPK/ERK e, ao modularem esta via, podem influenciar a função do PAQR4. O SP600125 e o SB203580 são inibidores da JNK e da p38 MAPK, respetivamente, e a sua inibição pode afetar as vias de sinalização que podem estar relacionadas com o papel regulador do PAQR4 nas células. A rapamicina é um inibidor do mTOR, um regulador-chave do crescimento e do metabolismo celular, que pode ter efeitos a jusante na atividade ou expressão do PAQR4. O KN-93 inibe a CaMKII, que faz parte da via de sinalização do cálcio, podendo assim modificar a atividade do PAQR4 através de alterações na homeostase do cálcio.
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