Os inibidores do LRRC46, a tricostatina A e a 5-azacitidina, modulam os marcadores epigenéticos, como a acetilação das histonas e a metilação do ADN, respetivamente. As alterações nestes estados epigenéticos podem levar a alterações nos padrões de expressão dos genes, incluindo potencialmente a expressão do LRRC46. O MG132 e a Brefeldina A interferem com o sistema ubiquitina-proteassoma e com o tráfico de proteínas no interior da célula, respetivamente, o que pode afetar a estabilidade e a localização do LRRC46 ou dos seus parceiros de interação.
Compostos como a cloroquina e a forskolina perturbam a função endossómica e os níveis de cAMP, respetivamente, influenciando potencialmente as vias de sinalização e os processos celulares em que o LRRC46 está envolvido. A genisteína, o LY294002 e o PD98059 são inibidores que têm como alvo actividades enzimáticas como as tirosina quinases, PI3K e MEK, respetivamente. Estas enzimas desempenham um papel fundamental na transdução de sinais e a sua inibição pode levar a respostas celulares alteradas que podem interferir com a função ou expressão do LRRC46. A rapamicina, o SB431542 e o Z-VAD-FMK influenciam as principais vias reguladoras relacionadas com o crescimento, a diferenciação e a apoptose celulares. A inibição da mTOR pela rapamicina, o SB431542, que tem como alvo a sinalização do TGF-beta, e a inibição das caspases pelo Z-VAD-FMK podem levar a modificações nas decisões sobre o destino e a sobrevivência das células, processos que poderiam implicar o LRRC46.
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