A Wortmannin e o LY294002, que são conhecidos pela sua precisão em impedir a atividade da PI3K. A interrupção da PI3K não só interrompe a sua sinalização imediata, como também afecta em cascata uma série de vias subsequentes, alterando potencialmente a paisagem funcional das proteínas que dependem destes sinais para ativação ou repressão. A triciribina tem como alvo a Akt, uma proteína quinase específica da serina/treonina que é crucial em várias vias de sinalização, incluindo as responsáveis pela sobrevivência celular. Ao inibir a Akt, a triciribina exerce um efeito dominó, afectando o papel da proteína nestas vias. Da mesma forma, o PD98059 e o U0126, ao centrarem a sua ação na MEK1/2, têm a capacidade de modular a via MAPK/ERK - um interveniente fundamental na proliferação e diferenciação celular. Esta modulação pode alterar significativamente a atividade das proteínas subsequentes a esta via.
Depois, há os compostos que visam as vias de resposta ao stress: SB203580 e SP600125, que inibem a p38 MAP kinase e a JNK, respetivamente. A sua ação pode influenciar proteínas envolvidas nas respostas celulares ao stress, à inflamação e à apoptose, indicando o amplo alcance destes inibidores para além dos seus alvos imediatos. A rapamicina, outro inibidor, tem como alvo o mTOR, um componente integrante das vias de crescimento e sobrevivência celular. Ao inibir o mTOR, a rapamicina pode afetar indiretamente a atividade de proteínas que funcionam no âmbito destes processos celulares críticos. Os efeitos da síntese e degradação de proteínas são também cruciais na regulação da atividade proteica. A cicloheximida, ao inibir a síntese de proteínas eucarióticas, pode reduzir drasticamente os níveis de uma proteína na célula. Em contrapartida, os inibidores do proteassoma, como o MG132 e o Bortezomib, impedem a degradação das proteínas, elevando assim a sua concentração celular. Esta elevação pode levar a mudanças significativas na função celular devido à alteração da abundância de proteínas, incluindo as que podem estar envolvidas na regulação do ciclo celular e na apoptose. Por último, o inibidor da quinase da família Src, PP2, demonstra a complexidade das redes de sinalização celular ao perturbar várias vias que podem controlar a função ou a atividade de uma determinada proteína.
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