A Wortmannin e o LY294002 actuam como inibidores arquetípicos das fosfoinositídeos 3-quinases (PI3K), enzimas fundamentais nas vias de sinalização que regulam o crescimento e a sobrevivência das células. Através da sua ação, podem modular inadvertidamente a atividade do LOC729963, abafando a cascata de sinalização que, de outro modo, poderia culminar na sua ativação ou expressão. A tricostatina A, um potente inibidor da histona desacetilase, altera o estado de acetilação das proteínas histónicas, influenciando assim a dinâmica da cromatina e a regulação da transcrição de numerosos genes, com potenciais ramificações na expressão do LOC729963.
A rapamicina, um inibidor da mTOR, actua impedindo um nó central na via da síntese proteica, o que poderá ter efeitos subsequentes na síntese de LOC729963 ou das suas proteínas reguladoras associadas. Da mesma forma, os inibidores da MEK, como o U0126 e o PD98059, têm como alvo específico a via MAPK/ERK, um eixo de sinalização conhecido por afetar uma infinidade de funções celulares, possivelmente incluindo as de LOC729963. O SB203580 e o SP600125, que inibem a p38 MAP quinase e a JNK, respetivamente, podem alterar o estado de fosforilação dos factores de transcrição e de outras proteínas que se associam indiretamente ao LOC729963, afectando a sua função ou estabilidade. O MG132, um inibidor do proteassoma, pode impedir a degradação da proteína, causando potencialmente uma acumulação de proteínas reguladoras que poderiam influenciar a atividade do LOC729963. Sabe-se que o inibidor da pan-caspase Z-VAD-FMK bloqueia a apoptose, um processo que pode estar incidentalmente ligado aos mecanismos reguladores do LOC729963, influenciando assim o seu papel nas vias de morte celular. Tanto a tapsigargina como a ciclosporina A modulam os níveis de cálcio intracelular, com a tapsigargina a inibir a bomba SERCA e a ciclosporina A a ter como alvo a calcineurina. A perturbação da sinalização do cálcio pode ter consequências de grande alcance que se estendem à função ou à regulação do LOC729963.
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