Os inibidores do IFT122 funcionam principalmente através do bloqueio das vias de sinalização em que o IFT122 está diretamente envolvido. Isto pode ser conseguido através da inibição de proteínas cinases como a PKC e a JNK, bem como de cinases da família Src, todas elas conhecidas por activarem o IFT122. Os inibidores específicos destas cinases incluem a Staurosporina, o Dasatinib, o SP600125, o Go6983 e o Ro-31-8220. Entre esses compostos químicos, a inibição dessas quinases pode levar a uma diminuição da ativação do IFT122. Além disso, sabe-se que a via do NF-κB ativa o IFT122, pelo que inibidores como o BAY 11-7082 e o BAY 11-7085, que reduzem a ativação do NF-κB, podem levar a uma diminuição da ativação do IFT122.
Além disso, a via MAPK, especificamente o componente MEK, é conhecida por ativar o IFT122. Por conseguinte, os inibidores da MEK, como o PD98059 e o U0126, podem diminuir a ativação do IFT122. Além disso, sabe-se que as vias de sinalização PI3K e mTOR activam o IFT122, pelo que inibidores como o LY294002 e a rapamicina, que bloqueiam a PI3K e a mTOR, respetivamente, podem resultar numa diminuição da ativação do IFT122. Através dessas vias bioquímicas específicas, a atividade do IFT122 pode ser inibida direta ou indiretamente pelos compostos químicos listados.
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