Os inibidores químicos da KRTAP12-1 podem ser entendidos como um conjunto diversificado de moléculas que interferem com a função da proteína, perturbando processos celulares específicos ou vias essenciais para a atividade da proteína. O sulfato de cobre (II) e o cloreto de zinco actuam perturbando a homeostase dos iões metálicos, que é crucial para a estabilidade estrutural e a atividade de proteínas dependentes de metais como a KRTAP12-1, inibindo eficazmente a sua ligação a substratos essenciais. O ortovanadato de sódio tem como alvo as proteínas tirosina fosfatases, o que levaria à sua inibição funcional. Do mesmo modo, o vermelho de alizarina S quelata os iões de cálcio, que podem ser necessários para a integridade funcional da KRTAP12-1, perturbando assim a sua atividade.
A genisteína, como inibidor da tirosina quinase, pode impedir a fosforilação de proteínas que fazem parte da rede reguladora do KRTAP12-1, o que é essencial para a sua atividade. PD98059 e U0126, ambos inibidores de MEK, podem suprimir a via MAPK/ERK, o que resultaria na inibição da proteína. O LY294002 e a Wortmannin, inibidores da PI3K, interromperiam a sinalização PI3K/AKT; estes inibidores levariam à sua inibição funcional. A inibição da p38 MAPK pelo SB203580 e a inibição da JNK pelo SP600125, ambos pertencentes às vias de sinalização da MAPK, interfeririam da mesma forma na função do KRTAP12-1. Por último, a cicloheximida interrompe a síntese proteica, o que impediria a produção de KRTAP12-1, reduzindo assim a sua presença funcional na célula.
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