Os inibidores da queratina 36 consistem em Retinóides como a Acitretina e a Alitretinoína podem levar a alterações na expressão das queratinas através da ativação dos receptores retinóides que se ligam aos elementos de resposta do ADN nos promotores dos genes da queratina. Esta ação pode alterar a transcrição dos genes que codificam as proteínas da queratina, incluindo a K36, levando a alterações na composição da queratina. Os polifenóis, como o galato de epigalocatequina, podem influenciar de forma semelhante as vias de expressão genética que podem levar a ajustes nos rácios de queratina, afectando assim a integridade estrutural dos tecidos ricos em queratina.
Os agentes quelantes, como o clioquinol, podem perturbar o equilíbrio iónico no interior das células, o que é fundamental para o bom funcionamento e estrutura das queratinas. Os solventes como o DMSO têm a capacidade de perturbar as interacções hidrofóbicas, que são essenciais para a montagem adequada dos filamentos de queratina. Os agentes de reticulação, os agentes de glicação, os indutores de stress oxidativo e os detergentes como o formaldeído, o metilglioxal, a fenil-hidrazina e o SDS, respetivamente, podem alterar a estrutura física ou levar à degradação das queratinas, incluindo a K36, modificando diretamente a proteína ou o seu ambiente celular. Por último, inibidores específicos como a tunicamicina e a withaferina A podem afetar as modificações pós-traducionais das queratinas ou as interacções proteína-proteína necessárias para a formação de filamentos.
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