Os inibidores da HYPK centram-se principalmente na inibição da cinase, na perturbação da interação da cromatina e na alteração da regulação da transcrição. Por exemplo, o Dasatinib, um inibidor da Src quinase, interfere com a via de sinalização Src-Fyn. Isto tem um impacto direto no papel da HYPK na sinalização sináptica, uma vez que se sabe que a HYPK interage com componentes desta via. O ibrutinib, um inibidor da tirosina quinase de Bruton (BTK), interrupcao da cascata de sinalização BCR, na qual a HYPK está envolvida, especificamente no contexto do desenvolvimento e regulação das células B. O sorafenib actua como um inibidor da quinase RAF, prejudicando o papel da HYPK na via MAPK ao reduzir a fosforilação da ERK.
Outro subconjunto de inibidores visa a desacetilação das histonas e a remodelação da cromatina. A tricostatina A é um inibidor da HDAC que altera o estado de acetilação das histonas, afectando assim a expressão genética mediada pela HYPK. O JQ1, um inibidor do bromodomínio BET, perturba a remodelação da cromatina e reduz a capacidade da HYPK de interagir com os componentes da cromatina, afectando assim o seu papel na regulação dos genes. O bortezomib inibe a atividade do proteassoma, afectando assim as vias de degradação das proteínas, nas quais a HYPK desempenha um papel facilitador. Estes produtos químicos inibem coletivamente a função da HYPK através de uma multiplicidade de vias bioquímicas e celulares, quer diretamente quer através de uma série de reacções intermédias.
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