Os activadores HYDIN englobam um conjunto diversificado de compostos químicos que promovem indiretamente a atividade funcional do HYDIN através de várias vias de sinalização intracelular. Compostos como a forskolina, o rolipram, o IBMX e o dbcAMP actuam através de mecanismos que aumentam os níveis intracelulares de AMPc, um segundo mensageiro fundamental na sinalização celular. A forskolina estimula diretamente a adenilato ciclase, enquanto o Rolipram e o IBMX inibem as fosfodiesterases, impedindo a degradação do AMPc. Os níveis elevados de AMPc activam a proteína quinase A (PKA), que é conhecida por fosforilar as proteínas alvo envolvidas nos processos que o HYDIN regula. A milrinona e o isoproterenol contribuem ainda mais para este aumento da atividade da HYDIN mediada pelo AMPc, com a milrinona a inibir seletivamente a fosfodiesterase 3 e o isoproterenol a atuar como agonista beta-adrenérgico. O N6-Benzoil AMPc, como análogo estável do AMPc, tem uma função semelhante ao ativar diretamente a PKA, facilitando assim as cascatas de sinalização que conduzem à ativação funcional da HYDIN.
Além disso, activadores como a isonomicina, o A23187 e o calmidazólio visam a sinalização do cálcio, que também é fundamental para a regulação de numerosas funções celulares. A ionomicina e o A23187 actuam como ionóforos de cálcio, aumentando a concentração de cálcio intracelular, o que pode ativar as cinases dependentes de cálcio/calmodulina, influenciando a atividade da HYDIN. A inibição da calmodulina pelo Calmidazolium poderia melhorar indiretamente a função da HYDIN, alterando o equilíbrio da sinalização dependente de cálcio/calmodulina. Além disso, o forbol 12-miristato 13-acetato (PMA) ativa a proteína quinase C (PKC), que desempenha um papel na modulação das vias de sinalização de que a HYDIN faz parte.
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