Os inibidores químicos da Gm609 interferem com a atividade da proteína através de várias interacções moleculares e perturbações das vias de sinalização. A alsterpaulona actua para inibir as cinases dependentes da ciclina (CDK), que são vitais para os eventos de fosforilação de que a Gm609 pode depender para a sua função. Ao impedir as CDK, a alsterpaulona pode impedir a fosforilação de que o Gm609 necessita para ser ativado, inibindo assim a sua atividade. Do mesmo modo, o SB-216763 tem como alvo a glicogénio sintase quinase 3 (GSK-3), uma enzima chave em numerosas vias de sinalização. A inibição da GSK-3 interrompe essas vias, que podem ser parte integrante das funções que o Gm609 desempenha na célula. O LY294002 e a Wortmannin inibem as fosfoinositídeos 3-quinases (PI3K), o que leva a uma paragem na via PI3K/AKT, uma via de transdução de sinal crítica que o Gm609 pode utilizar para a sua atividade. Sem a sinalização da via PI3K/AKT, o papel da Gm609 na célula fica comprometido.
Continuando com este tema, PD98059, U0126 e ZM-447439 interrompem as vias MAPK/ERK e Aurora quinase, respetivamente. O PD98059 e o U0126 inibem especificamente a MEK1/2, que está a montante na via MAPK/ERK, uma via que pode ser essencial para a função do Gm609. Ao bloquear a MEK1/2, estes inibidores impedem a ativação da sinalização ERK/MAPK, que é frequentemente necessária para que proteínas como a Gm609 desempenhem as suas funções celulares. A inibição das cinases Aurora pelo ZM-447439 afecta a progressão do ciclo celular e os processos mitóticos, onde a atividade da Gm609 pode ser crucial. A rapamicina, ao inibir a mTOR, afecta a sinalização subsequentes que é necessária para a função do Gm609, enquanto o SP600125 actua na sinalização JNK, impedindo vias que podem ser críticas para o Gm609. O Y-27632 inibe a ROCK, alterando potencialmente a dinâmica do citoesqueleto e a via Rho/ROCK de que o Gm609 pode depender. Por último, o bortezomib interrompe a atividade do proteassoma, conduzindo ao stress celular e afectando os processos que envolvem o Gm609. O sunitinib, como inibidor da tirosina quinase, pode interferir nas vias de sinalização e nos processos celulares em que a atividade do Gm609 está envolvida, bloqueando os eventos de fosforilação que as tirosina quinases catalisam. Cada um destes inibidores químicos visa interacções e vias moleculares específicas para inibir eficazmente a atividade funcional do Gm609.
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