Os inibidores químicos da GLT8D2 podem exercer os seus efeitos inibitórios através de vários mecanismos bioquímicos, principalmente perturbando os processos de glicosilação e de dobragem da proteína. A swainsonina actua como um inibidor da Golgi alfa-manosidase II, uma enzima chave na via da glicosilação. Ao bloquear esta enzima, a swainsonina pode inibir a glicosilação adequada do GLT8D2, que é crucial para a sua correcta dobragem e função. A desoxinojirimicina também tem como alvo a via de glicosilação, mas concentra-se na inibição das alfa-glucosidases. Isto pode levar a uma glicosilação e dobragem incorrectas do GLT8D2, resultando numa perda de função. Do mesmo modo, a inibição da alfa-glucosidase pela castanospermina pode alterar o estado de glicosilação do GLT8D2, afectando a sua atividade. A 1-deoxymannojirimycin e a kifunensine têm como alvo outros aspectos da maquinaria de glicosilação, com a 1-deoxymannojirimycin a inibir as manosidases e a kifunensine a inibir a manosidase I. Estes inibidores podem impedir a maturação adequada do GLT8D2, levando a uma deformação incorrecta e à inibição funcional.
O salubrinal, o guanabenz e o Sephin1 inibem factores envolvidos na regulação da síntese proteica. O salubrinal inibe seletivamente a fosfatase eIF2α, levando à redução da tradução proteica, o que pode diminuir indiretamente os níveis funcionais de GLT8D2. O guanabenz inibe preferencialmente a desfosforilação de eIF2α, reduzindo a síntese de GLT8D2. Sephin1 inibe especificamente a desfosforilação mediada por PPP1R15A de eIF2α, que é ativada em condições de stress, reduzindo potencialmente a atividade de GLT8D2. Em contraste, o ISRIB aumenta a atividade do eIF2B e pode contrariar a redução da síntese de GLT8D2 sob stress. A tunicamicina é outra substância química que perturba a glicosilação, mas fá-lo inibindo a glicosilação ligada à N, que é outra modificação pós-traducional importante para o funcionamento correto do GLT8D2. A brefeldina A perturba a função do aparelho de Golgi, que é essencial para o processamento e a função do GLT8D2.
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