Os inibidores de Gap1 actuam em várias junções moleculares para exercer um efeito atenuante sobre a função de Gap1. Por exemplo, o LY294002 e a Wortmannin são inibidores da fosfatidilinositol 3-quinase (PI3K) que interrompem a cascata de sinalização PI3K-Akt. O efeito subsequentes desta interrupção é a reduzida se transloca de Gap1 para a membrana plasmática. A rapamicina é outro exemplo digno de nota, actuando como um inibidor de mTOR que interrompe especificamente a função de TORC1. Ao inibir este complexo, a rapamicina influencia a localização celular de Gap1, mantendo-a afastada da membrana. Além disso, os inibidores da PKC, como a Staurosporina e a Calfostina C, inibem a proteína quinase C, que é conhecida por fosforilar a Gap1 e, consequentemente, activá-la. A interrupção deste evento de fosforilação pelos inibidores da PKC leva à desativação do Gap1.
Além disso, os inibidores da quinase que visam moléculas específicas nas vias de sinalização, como PP2 para Src quinase, U0126 e PD98059 para MEK, SB203580 para p38 MAPK e AG490 para JAK2, afectam a ativação e a expressão de Gap1 de uma forma mais indireta. Por exemplo, a PP2 inibe a cinase Src, que fosforila Gap1 para a sua ativação; a ausência dessa fosforilação mantém Gap1 num estado inativo. Da mesma forma, o U0126 e o PD98059 inibem a MEK, e a atenuação resultante da via da ERK leva a uma diminuição da transcrição de Gap1. Estes inibidores actuam perturbando as vias bioquímicas associadas em pontos distintos, levando a uma modulação eficaz da função de Gap1 sem alterar a sua integridade estrutural.
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