A forskolina actua como um potente ativador da adenilato ciclase, que catalisa a conversão de ATP em cAMP, um segundo mensageiro fundamental em várias vias de sinalização. O aumento dos níveis intracelulares de AMPc facilita a ativação da proteína quinase A (PKA), que pode fosforilar uma vasta gama de proteínas, incluindo potencialmente o FLJ37644. Paralelamente, o IBMX actua para manter níveis elevados de AMPc através da inibição das fosfodiesterases, enzimas responsáveis pela degradação do AMPc. O PMA ativa a proteína quinase C (PKC), uma família de enzimas essenciais para controlar a função de outras proteínas através da fosforilação, enquanto a ionomicina funciona através do aumento dos níveis de cálcio intracelular, activando assim proteínas e enzimas dependentes do cálcio. Tanto o PMA como a isonomicina, ao modularem as vias de sinalização da PKC e do cálcio, respetivamente, criam um efeito de ondulação que pode estender-se à regulação de proteínas como a FLJ37644.
O LY294002 e o PD98059 são representativos de moléculas que inibem enzimas-chave em vias específicas, com o LY294002 a visar a via PI3K/Akt e o PD98059 a inibir a via MEK/ERK. Ao inibir estas vias, estes compostos alteram a fosforilação e os estados de atividade de várias proteínas e enzimas a jusante, o que pode levar a uma alteração do estado de atividade do FLJ37644. Outros compostos, como o U0126, o SB203580 e o SP600125, são todos inibidores da quinase que têm como alvo diferentes membros da família da MAP quinase, modulando assim as respostas celulares mediadas por estas quinases, incluindo o crescimento celular, a diferenciação e as respostas ao stress. A rapamicina inibe a mTOR, uma proteína central numa via que controla o crescimento e o metabolismo celular, o que poderá ter implicações na atividade do FLJ37644. A tapsigargina e o EGF funcionam perturbando o armazenamento intracelular de cálcio e a ligação ao recetor do EGF, respetivamente, levando à ativação de várias cascatas de sinalização a jusante.
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