Os inibidores da FAM71E2 englobam uma variedade de compostos que afectam indiretamente a atividade da proteína ao visarem o citoesqueleto de actina e as vias de sinalização relacionadas. A wiskostatina e o CK-0944666 manipulam a dinâmica da actina através da inibição da N-WASP e da estabilização dos filamentos de actina, respetivamente. Estas acções resultam num citoesqueleto de actina modificado, que é essencial para as funções associadas ao FAM71E2. O ML141 e o IPA-3 têm como alvo as GTPases que estão diretamente envolvidas na polimerização e remodelação da actina. Ao inibir Cdc42 e Pak1, esses compostos podem levar à redução da dinâmica da actina, o que poderia, por sua vez, inibir a função de FAM71E2, se esta depender da integridade e da dinâmica do citoesqueleto de actina.
Além disso, compostos como a queleritrina e o NSC23766 interferem com as vias de sinalização da proteína quinase C e da Rac1, ambas cruciais para a manutenção da estrutura e da dinâmica da actina. A inibição destas cinases pode levar à alteração da organização da actina, o que poderia potencialmente inibir a função do FAM71E2 associada a processos baseados na actina. Do mesmo modo, SMIFH2, Y-27632 e Dimetilfasudil têm como alvo a regulação da nucleação da actina e a maquinaria contrátil, inibindo os processos mediados pela formin e a via da proteína quinase associada à Rho (ROCK), respetivamente. Estes inibidores podem perturbar a formação e estabilização dos filamentos de actina, que são críticos para as funções em que o FAM71E2 está envolvido. O ZCL278 e o EHop-016 inibem especificamente a sinalização de Cdc42 e Rac1, apoiando ainda mais a noção de que a modulação das vias de pequenas GTPases pode ter um impacto significativo na atividade funcional do FAM71E2, alterando o citoesqueleto de actina.