A forskolina, um conhecido ativador da adenilato ciclase, aumenta eficazmente os níveis intracelulares de AMPc, que, por sua vez, pode ativar a proteína quinase A (PKA). A ativação da PKA é um passo fundamental na fosforilação de numerosas proteínas alvo, o que pode resultar na alteração da função e da atividade das proteínas. O AICAR, através da sua ativação da proteína quinase activada por AMP (AMPK), desempenha um papel crucial na homeostase energética celular, influenciando vários aspectos da atividade proteica e do metabolismo celular. No contexto da sinalização intracelular, o cloreto de lítio surge como um inibidor da glicogénio sintase quinase-3 beta (GSK-3β), podendo assim ativar proteínas envolvidas na via de sinalização Wnt, uma via integrante da proliferação e diferenciação celular. A tricostatina A e a 5-azacitidina, ao modularem a estrutura da cromatina e a metilação do ADN, respetivamente, exercem efeitos profundos na expressão genética e, consequentemente, na síntese e atividade proteicas. Além disso, o inibidor do proteassoma MG132 impede a degradação de proteínas, o que pode levar à estabilização e acumulação de proteínas alvo, incluindo a FAM221B.
Mais ao longo do espetro da modulação da sinalização celular, o 12-miristato 13-acetato de forbol (PMA) ativa a proteína quinase C (PKC), uma quinase que regula uma multiplicidade de funções celulares, incluindo o crescimento celular e a apoptose. O SB431542 actua na via de sinalização do fator de crescimento transformador-beta (TGF-β) inibindo a quinase ALK5, afectando a cascata de sinalização SMAD. O Y-27632, ao inibir a quinase associada à Rho (ROCK), pode ter impacto na dinâmica do citoesqueleto, que está intimamente ligada à regulação da atividade proteica. Os inibidores da JNK, como o SP600125, influenciam a atividade do fator de transcrição AP-1, afectando ainda mais a função proteica. A PI3K e a mTOR são nós centrais nas redes de sinalização da sobrevivência celular e do metabolismo, com o LY294002 a inibir a PI3K e a rapamicina a visar a mTOR, cada uma delas conduzindo a uma cascata de efeitos nas actividades proteicas a jusante.
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