Os inibidores da quinase FAM100B, como a Wortmannin, U0126, SB203580 e SP600125, têm como alvo diferentes cinases envolvidas na sinalização celular, o que pode afetar indiretamente qualquer proteína que seja regulada ou dependa destas vias de sinalização. A tricostatina A e a 5-azacitidina podem alterar os perfis de expressão dos genes através da modificação da estrutura da cromatina e da metilação do ADN, respetivamente, o que pode influenciar a expressão de uma vasta gama de proteínas, incluindo a FAM100B. O bortezomib e o Z-VAD-FMK podem modular a degradação das proteínas e a apoptose, afectando potencialmente a estabilidade ou a renovação do FAM100B.
O LY294002 e a rapamicina inibem especificamente as vias de sinalização PI3K/Akt e mTOR, que são fundamentais para várias funções celulares, incluindo o crescimento e o metabolismo, podendo assim ter um efeito indireto nas proteínas que são reguladas por estas vias. A ciclosporina A e o PD173074 são mais específicos na sua ação sobre a calcineurina e os receptores do fator de crescimento dos fibroblastos, respetivamente, mas também exemplificam como a alteração de uma determinada molécula de sinalização pode ter efeitos subsequentes numa série de proteínas celulares.
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