Os inibidores químicos do EGL-27 podem exercer os seus efeitos inibitórios através de vários mecanismos associados à regulação da expressão genética, modificando a estrutura da cromatina. Sabe-se que os inibidores da histona desacetilase (HDACi), como a tricostatina A, o vorinostato, o panobinostato, a romidepsina, o ácido valpróico, o entinostato, o belinostato, o SAHA, o sirtinol, o mocetinostato, a chidamida e a tacedinalina, provocam uma acumulação de histonas acetiladas. Esta hiperacetilação altera a estrutura da cromatina, o que pode levar a uma alteração da expressão de uma série de genes, incluindo os que são cruciais para a atividade funcional do EGL-27. Por exemplo, o vorinostat e o SAHA, que são essencialmente o mesmo produto químico, inibem o EGL-27 criando um estado de cromatina mais aberto que pode interferir com os programas de transcrição em que o EGL-27 está envolvido. Do mesmo modo, a romidepsina pode alterar a paisagem da cromatina, modulando assim os factores de transcrição e as redes de genes que são essenciais para as funções biológicas do EGL-27.
O entinostato e o belinostato têm como alvo histonas desacetilases específicas, que podem estar envolvidas na regulação de genes críticos para a atividade do EGL-27. Ao inibir estas enzimas, estes produtos químicos interrompem o processo normal de desacetilação que é necessário para a repressão transcricional dos genes associados à atividade do EGL-27. Além disso, o Sirtinol inibe as sirtuínas histona desacetilases que estão envolvidas nas vias de longevidade e de resposta ao stress, conduzindo a alterações nos padrões de expressão dos genes que, em última análise, inibem o EGL-27. O Mocetinostat e a Chidamide afectam de forma semelhante o estado de acetilação das histonas, o que, por sua vez, influencia a expressão de genes em que o EGL-27 desempenha um papel regulador. Por último, a tacedinalina inibe o EGL-27 ao afetar a dinâmica da cromatina, que é um regulador crítico da expressão genética e é suscetível de ter impacto nas vias em que o EGL-27 actua. Ao alterar a expressão dos genes nestas vias, estes inibidores contribuem coletivamente para a inibição funcional do EGL-27.
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