A Wortmannin e o LY294002 são inibidores da PI3K, um regulador ascendente da via de sinalização AKT, que afecta numerosos processos celulares, incluindo os que podem envolver o CCDC135. A rapamicina e o Torin 1 têm como alvo a via mTOR, que desempenha um papel central no controlo do crescimento e da proliferação celular. Estes inibidores podem ter efeitos profundos nos processos celulares, potencialmente em intersecção com quaisquer funções que o CCDC135 possa ter nestas vias. O PD98059 e o U0126, que inibem as enzimas MEK1/2, juntamente com o SB203580, que tem como alvo a p38 MAPK, e o SP600125, que tem como alvo a JNK, estão todos envolvidos na via MAPK/ERK, um regulador crítico da divisão celular, diferenciação e resposta a sinais de stress.
Outros compostos como o Gefitinib e o Imatinib inibem tirosina quinases específicas associadas à sinalização do fator de crescimento, influenciando assim possivelmente as vias de sinalização que se cruzam com a função do CCDC135. A triciribina é um inibidor da AKT, que, ao modular a sinalização da AKT, pode afetar processos em que o CCDC135 está envolvido. O ZM447439 tem como alvo as cinases Aurora que desempenham papéis fundamentais na progressão mitótica, o que pode levar a alterações nos processos celulares que envolvem potencialmente o CCDC135.
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