A forskolina e o IBMX funcionam aumentando os níveis de AMPc na célula, aumentando assim a atividade da proteína quinase A. Esta quinase é fundamental na fosforilação de proteínas, incluindo o CBWD3, influenciando assim a sua atividade. Do mesmo modo, o PMA tem como alvo a proteína quinase C, que também fosforila substratos na célula, afectando potencialmente o estado e a função do CBWD3. A ionomicina, ao aumentar os níveis de cálcio intracelular, ativa as cinases dependentes da calmodulina que podem contribuir para a cascata de fosforilação, incluindo a modulação do CBWD3. O EDTA, como agente quelante, perturba o equilíbrio dos iões metálicos e pode alterar indiretamente a função das enzimas dependentes de metais e as vias de sinalização que podem ser cruciais para a regulação do CBWD3.
Além disso, compostos como a genisteína actuam sobre as proteínas tirosina quinases, cuja inibição pode alterar os padrões de fosforilação na célula, possivelmente afectando o CBWD3. Os moduladores do estado da cromatina, como a Tricostatina A e o Butirato de Sódio, ao inibirem as histonas desacetilases, podem levar a uma alteração do panorama da expressão genética, afectando não só a expressão do CBWD3 mas também a sua dinâmica reguladora. Além disso, a incorporação da 5-azacitidina nos ácidos nucleicos resulta na hipometilação do ADN, que é outra via através da qual a expressão dos genes, incluindo a do CBWD3, pode ser modificada. Os inibidores da fosfoinositídeo 3-quinase, como o LY294002, interrompem a sinalização AKT, enquanto o U0126 e o SB203580, que inibem a MEK e a p38 MAP quinase, respetivamente, afectam a via MAPK/ERK. Estas vias são cruciais na transmissão de sinais celulares que controlam várias funções, incluindo a expressão e a atividade de proteínas como a CBWD3.
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