Os inibidores químicos da C9orf97 incluem uma gama de compostos que têm como alvo várias vias de sinalização e enzimas, prejudicando assim a função desta proteína. A alsterpaulona actua inibindo as cinases dependentes da ciclina, que são fundamentais para a progressão do ciclo celular. Uma vez que as proteínas relacionadas com o ciclo celular funcionam frequentemente em conjunto, a inibição das cinases dependentes da ciclina pela Alsterpaulona pode impedir a C9orf97 se esta estiver envolvida na regulação do ciclo celular. A Wortmannin e o LY294002, ambos inibidores da PI3K, obstruem a via de sinalização PI3K/Akt, levando a uma supressão do C9orf97 se este depender desta via para a sua atividade. Do mesmo modo, a triciribina visa a fosforilação da Akt, impedindo assim os sinais de ativação de que o C9orf97 possa necessitar para a sua função.
SB203580, U0126 e PD98059 são inibidores da via MAPK. O SB203580 inibe especificamente a p38 MAP kinase, enquanto o U0126 inibe a MEK1/2 e o PD98059 tem como alvo a MEK. Entre esses, cada um impediria a via de sinalização MAPK, resultando na inibição do C9orf97 se ele fizer parte dessa cascata de sinalização. O SP600125, um inibidor da JNK, suprime a atividade do C9orf97 ao visar a via de sinalização da JNK. O dasatinib, ao inibir as cinases da família Src, pode ter impacto na atividade do C9orf97 se este estiver sob o controlo regulador destas cinases. A rapamicina impede a via de sinalização mTOR, o que restringiria a atividade do C9orf97 se este estivesse envolvido em processos regulados por mTOR. A inibição da diidroorotato desidrogenase pela leflunomida leva a uma redução da síntese de pirimidina, o que pode limitar a atividade do C9orf97 se este depender da síntese de pirimidina. Por último, a talidomida, conhecida por promover a degradação de proteínas seleccionadas, pode inibir o C9orf97 se este for suscetível de ser regulado por vias de ubiquitinação influenciadas pela talidomida. Entre esses produtos químicos, cada um, ao visar vias celulares ou enzimas específicas, pode inibir eficazmente o C9orf97, interrompendo os processos nos quais ele se baseia ou bloqueando seus sinais reguladores.
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