A ciclosporina A, através da sua inibição da calcineurina, afecta a ativação das células T e, por conseguinte, quaisquer proteínas que sejam reguladas por vias de sinalização imunitária. O 2-metoxiestradiol perturba a dinâmica dos microtúbulos, o que pode influenciar as proteínas envolvidas no ciclo celular e no transportam intracelular. O PD173074, como inibidor do FGFR, tem a capacidade de afetar a sinalização do fator de crescimento, influenciando assim potencialmente as proteínas que fazem parte ou são reguladas por esta via. O ZM-447439 inibe as cinases Aurora, que são intervenientes fundamentais na progressão mitótica, podendo assim ter um impacto nas proteínas associadas à divisão celular. O NSC 23766 tem como alvo a GTPase Rac1, alterando o citoesqueleto de actina e afectando potencialmente as proteínas ligadas à motilidade celular.
O LY294002 inibe a PI3K, uma molécula de sinalização central em vias envolvidas na sobrevivência e metabolismo celular, afectando assim proteínas reguladas por este eixo. O SP600125, como inibidor da JNK, influencia as vias de resposta ao stress e, por conseguinte, a atividade das proteínas moduladas por essas vias. O Y-27632 inibe a ROCK, que desempenha um papel crucial na organização do citoesqueleto e na adesão celular, afectando as proteínas associadas. O SB431542 actua nos receptores TGF-beta, influenciando as vias de sinalização que regulam a diferenciação e a proliferação celular, podendo assim modular a atividade de proteínas relevantes.
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