Os inibidores químicos da C6orf162 podem atuar em várias vias de sinalização em que esta proteína está envolvida, reduzindo assim a sua atividade. Sabe-se que a Wortmannin inibe a PI3K, que é fundamental em múltiplas cascatas de sinalização; quando a PI3K é inibida, a fosforilação subsequente da AKT é reduzida. Por conseguinte, se as funções de C6orf162 estiverem associadas à via PI3K/AKT, a sua atividade seria inibida. Do mesmo modo, o LY294002 é outro inibidor da PI3K que impede a ativação da AKT, levando a uma potencial supressão do C6orf162 se este fizer parte desta rede de sinalização. A triciribina visa especificamente a AKT, inibindo assim a sua ação e possivelmente reduzindo a atividade do C6orf162 se este estiver subsequentes à AKT.
Além disso, a rapamicina inibe a mTOR, uma proteína central nas vias de crescimento e proliferação celular. Uma vez que a mTOR pode afetar uma vasta gama de proteínas subsequentes, a inibição da mTOR poderia levar a uma diminuição da atividade do C6orf162 se este estiver implicado nestas vias. O PD98059 e o U0126 são ambos inibidores da MEK, que está a montante da ERK na via MAPK/ERK. Se o C6orf162 for regulado por esta via, estes inibidores suprimiriam a sua atividade ao impedir a ativação da ERK. O SB203580 e o SP600125 têm como alvo a p38 MAPK e a JNK, respetivamente, que são outros membros da família MAPK. A inibição destas cinases reduziria a atividade de C6orf162 se este estivesse envolvido na resposta ao stress ou noutros processos mediados por p38 MAPK ou JNK. Além disso, o Dasatinib e o PP2 são inibidores das cinases da família Src. Se o C6orf162 interage com vias sob o controlo das cinases da família Src, a atividade do C6orf162 seria inibida por estes produtos químicos. Por último, o Go6983 é um inibidor de largo espetro da PKC, que desempenha um papel em vários processos de sinalização celular; a inibição da PKC pode levar à redução da atividade do C6orf162 se este fizer parte de vias reguladas pela PKC. O SL327, que também inibe a MEK, asseguraria ainda mais a desregulação da atividade da ERK e, consequentemente, a atividade do C6orf162 se este for um componente da via de sinalização MEK/ERK.
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