Os inibidores químicos do C6orf118 podem atuar através de várias vias bioquímicas para impedir a sua função. A estaurosporina funciona como um inibidor da cinase, visando as cinases ascendentes que regulam o C6orf118, levando assim à sua inibição funcional. Do mesmo modo, o LY294002 e a Wortmannin são ambos inibidores da PI3K, que interrompem a via de sinalização PI3K/AKT. Uma vez que o C6orf118 está implicado nestas cascatas de sinalização, a perturbação da PI3K pode levar a uma atividade reduzida do C6orf118. Além disso, a rapamicina, um inibidor da mTOR, pode regular negativamente a atividade de proteínas subsequentes à mTOR que podem interagir ou regular o C6orf118, resultando na sua inibição. Inibidores como o Bortezomib, que impede a atividade do proteassoma, podem levar a um elevado número de proteínas mal dobradas, potencialmente perturbando o C6orf118 através de stress proteotóxico. A geldanamicina liga-se à Hsp90 e inibe a sua função acompanhante, que pode ser crucial para a correcta dobragem e estabilidade do C6orf118, impedindo assim a sua função.
Além disso, a ciclosporina A, um inibidor da calcineurina, pode diminuir as actividades dependentes do cálcio do C6orf118, uma vez que este está envolvido nas vias de sinalização do cálcio. Os inibidores da quinase, como o SB203580, PD98059, SP600125 e U0126, têm como alvo específico as MAPKs, como a p38 MAPK, MEK e JNK. A inibição destas cinases leva à redução da fosforilação e ativação de proteínas que podem ser essenciais para a função do C6orf118. Por exemplo, a inibição da MEK1/2 pelo U0126 leva a uma diminuição da ativação da via da ERK, que é potencialmente necessária para o papel do C6orf118. Por último, o ZM-447439 tem como alvo as cinases Aurora, que podem estar envolvidas em processos celulares partilhados com o C6orf118; a sua inibição poderia resultar na inibição funcional do C6orf118, demonstrando a natureza interligada das vias de sinalização celular e a sua influência na função das proteínas.
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