A forskolina, através da sua estimulação da adenilato ciclase, inicia uma cascata que aumenta os níveis intracelulares de AMPc, levando à ativação da proteína quinase A. Esta quinase é fundamental na fosforilação de diversas proteínas, que podem incluir o C16orf89, modulando assim a sua atividade. A ionomicina, com a sua capacidade de elevar o cálcio intracelular, ativa as cinases dependentes do cálcio, que, por sua vez, podem fosforilar e ativar o C16orf89. O 12-miristato 13-acetato de forbol, vulgarmente conhecido como PMA, actua como ativador da proteína quinase C, outra quinase que desencadeia eventos de fosforilação e que poderia potencialmente ter como alvo o C16orf89. No domínio da expressão genética, a 5-azacitidina perturba os padrões de metilação do ADN, podendo levar a uma maior expressão de vários genes, entre os quais o C16orf89 pode ser afetado. Do mesmo modo, a tricostatina A inibe as histonas desacetilases, afectando assim a estrutura da cromatina e aumentando possivelmente a transcrição de genes como o C16orf89.
Os inibidores de pequenas moléculas, como o SB 431542 e o SP600125, actuam inibindo a sinalização do TGF-β e da JNK, respetivamente. Estas vias estão intimamente ligadas à modulação da expressão génica e a sua inibição pode levar a uma regulação positiva compensatória das proteínas, incluindo o C16orf89. O LY294002 e o PD98059, ao visarem a PI3K e a MEK, interrompem vias de cinase específicas, conduzindo potencialmente a alterações nos mecanismos reguladores que controlam o C16orf89. A rapamicina, um conhecido inibidor da via mTOR, tem amplas implicações na síntese proteica e pode desempenhar um papel na regulação da produção de C16orf89. O agonista Wnt 1 estimula a via Wnt, levando a alterações transcricionais de genes que poderiam abranger a regulação positiva do C16orf89. O dibutiril-cAMP, um análogo do cAMP, contorna os receptores celulares e ativa diretamente a PKA, o que pode levar à fosforilação e subsequente ativação do C16orf89.
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