Os inibidores que visam a atividade funcional do C11orf47 incluem uma gama de compostos que actuam em várias vias celulares e moleculares. Estes inibidores são seleccionados com base no pressuposto de que o C11orf47 está envolvido ou é afetado por estas vias. O LY294002 e a Wortmannin, por exemplo, inibem a via PI3K/AKT, uma cascata de sinalização crítica que regula a sobrevivência e a proliferação celular. Se o C11orf47 for um substrato da AKT, a inibição da PI3K resultaria numa redução da fosforilação e da atividade subsequente do C11orf47, uma vez que a PI3K está a montante da AKT.
Do mesmo modo, compostos como PD98059, U0126, SP600125 e SB203580 visam a cascata de sinalização MAPK em diferentes pontos. O PD98059 e o U0126 inibem a MEK, que está a montante da ERK1/2, enquanto o SP600125 e o SB203580 inibem especificamente a JNK e a p38 MAPK, respetivamente. Se o C11orf47 for um efector a jusante de uma ou mais destas MAPKs, a sua atividade seria diminuída na presença destes inibidores devido à redução dos sinais de fosforilação. A inibição da sinalização mTOR pela rapamicina, que desempenha um papel central no crescimento e metabolismo das células, poderia reduzir de forma semelhante a atividade do C11orf47 se este fizer parte da rede de sinalização mTOR.
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