A forskolina é conhecida pela sua capacidade de aumentar os níveis intracelulares de AMPc, que subsequentemente ativa a PKA e pode levar a um estado de fosforilação melhorado na célula, uma condição que pode favorecer a atividade da β3Gn-T9. O galato de epigalocatequina (EGCG) e a genisteína produzem os seus efeitos através de várias vias; enquanto o EGCG tem uma ampla influência nas moléculas e vias de sinalização, a genisteína inibe especificamente as tirosina quinases, ambas culminando num estado celular que pode promover a função da β3Gn-T9. Da mesma forma, os inibidores de pequenas moléculas como LY294002, Rapamicina, SB203580, PD98059 e SP600125 têm como alvo cinases e proteínas reguladoras cruciais, criando efetivamente um efeito dominó nas redes de sinalização que se podem propagar para aumentar a atividade biológica da β3Gn-T9.
A ionomicina eleva o cálcio intracelular, um mensageiro secundário fundamental em numerosas cascatas de sinalização, que pode ativar proteínas dependentes do cálcio e, possivelmente, resultar numa atividade β3Gn-T9 aumentada. Em contrapartida, o butirato de sódio e a 5-azacitidina exercem a sua influência alterando a paisagem epigenética, com o butirato de sódio a inibir as histonas desacetilases e a 5-azacitidina a interferir com a metilação do ADN. Estas modificações podem conduzir a um estado de cromatina mais ativo a nível da transcrição, aumentando potencialmente a expressão do gene β3Gn-T9. O dibutiril-AMP (db-AMP), um análogo sintético do AMPc, pode imitar os efeitos do AMPc endógeno e ativar a PKA, promovendo assim um ambiente celular que suporta a atividade do gene β3Gn-T9.
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