Os inibidores da AUNIP são uma série de compostos químicos que exercem a sua influência desestabilizando ou alterando vários processos e vias celulares em que a AUNIP está intrinsecamente envolvida, em particular os associados à regulação do ciclo celular e à coesão dos centrossomas. Por exemplo, a Staurosporina e a Roscovitina, ambos inibidores da quinase, conduzem a uma redução dos níveis de fosforilação de proteínas nas vias celulares de que a AUNIP faz parte, reduzindo assim indiretamente a atividade funcional da AUNIP. Do mesmo modo, a tapsigargina aumenta os níveis de cálcio citosólico, perturbando potencialmente os mecanismos reguladores dependentes do cálcio que poderiam influenciar a função da AUNIP. Os inibidores da CDK, como o PD 0332991 e o Purvalanol B, também desempenham um papel ao interromperem a progressão do ciclo celular, que está estreitamente ligada ao papel regulador da AUNIP na coesão e função dos centrossomas.
Outros inibidores incluem o ZM-447439 e o Alisertib, que têm como alvo específico as cinases Aurora, afectando assim o alinhamento e a segregação dos cromossomas - um processo em que o papel da AUNIP é fundamental devido à sua associação com a integridade dos centrossomas. Além disso, inibidores como o BI6727, a S-Trityl-L-cisteína e o Monastrol perturbam a progressão mitótica e a montagem do fuso, ao visarem proteínas como a Plk1 e a cinesina mitótica Eg5, afectando assim indiretamente a função da AUNIP relacionada com a montagem do fuso mitótico. A Mitoxantrona e o Nocodazol, ao interferirem com a topoisomerase II e a dinâmica dos microtúbulos, respetivamente, contribuem para a inibição indireta da AUNIP ao afectarem a replicação do ADN e os processos de divisão celular que são essenciais para o funcionamento adequado da AUNIP no ciclo celular. Coletivamente, estes inibidores mostram a intrincada rede de vias em que a AUNIP está envolvida e, através destes diversos mecanismos, diminuem a atividade funcional da AUNIP sem alterar diretamente a sua expressão ou atividade.
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