Os inibidores químicos da ANKRD23 têm como alvo a proteína através de vários mecanismos directos e indirectos que dependem dos processos celulares específicos e das vias bioquímicas em que a ANKRD23 está envolvida. A esturosporina, um inibidor da proteína cinase de largo espetro, pode impedir a fosforilação da ANKRD23. Esta inibição pode manter o ANKRD23 num estado inativo. Do mesmo modo, a ivermectina pode alterar o equilíbrio iónico, levando à perda de atividade do ANKRD23. A brefeldina A pode perturbar as vias de transporte intracelular; se a ANKRD23 necessitar de translocação para funcionar eficazmente, este produto químico resultaria na sua inibição funcional devido a uma localização incorrecta.
Além disso, o MG132 pode levar à acumulação de proteínas reguladoras que regulam a atividade do ANKRD23, inibindo o proteassoma, que de outra forma poderia degradar esses reguladores. Esta acumulação pode inibir a ANKRD23. A ciclosporina A, através da sua inibição da calcineurina, pode manter o ANKRD23 num estado fosforilado e potencialmente inativo se a desfosforilação for necessária para a sua função. O LY294002 e a rapamicina, inibidores das vias PI3K e mTOR, respetivamente, podem diminuir a atividade do ANKRD23. O U0126 e o PD98059 concentram-se na via MAPK/ERK, pelo que a sua atividade seria reduzida por estes produtos químicos. O WZB117, que inibe o transporte de glicose, pode suprimir a função do ANKRD23 ao limitar o fornecimento de energia necessário para a sua atividade. A tapsigargina, ao perturbar a homeostase do cálcio, pode inibir a ANKRD23. Por último, o KN-93 inibe especificamente a CaMKII, o que pode resultar na inibição funcional da ANKRD23.
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